Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rims3Q80U57 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rims3Q80U57 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms