Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Avl9Q80U56 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Avl9Q80U56 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Avl9Q80U56 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Avl9Q80U56 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Avl9Q80U56 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Avl9Q80U56 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Avl9Q80U56 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Avl9Q80U56 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Avl9Q80U56 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Avl9Q80U56 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Avl9Q80U56 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Avl9Q80U56 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Avl9Q80U56 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Avl9Q80U56 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Avl9Q80U56 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Avl9Q80U56 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Avl9Q80U56 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Avl9Q80U56 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Avl9Q80U56 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Avl9Q80U56 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Avl9Q80U56 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Avl9Q80U56 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Avl9Q80U56 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Avl9Q80U56 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Avl9Q80U56 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Avl9Q80U56 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Avl9Q80U56 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Avl9Q80U56 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Avl9Q80U56 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Avl9Q80U56 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Avl9Q80U56 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Avl9Q80U56 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms