Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifna12Q80SS5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms