Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lamp3Q7TST5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms