Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2q1Q7TSS2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms