Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Clec18aQ7TSQ1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clec18aQ7TSQ1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clec18aQ7TSQ1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Clec18aQ7TSQ1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Clec18aQ7TSQ1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Clec18aQ7TSQ1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Clec18aQ7TSQ1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Clec18aQ7TSQ1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clec18aQ7TSQ1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clec18aQ7TSQ1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Clec18aQ7TSQ1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clec18aQ7TSQ1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clec18aQ7TSQ1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clec18aQ7TSQ1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Clec18aQ7TSQ1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clec18aQ7TSQ1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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Clec18aQ7TSQ1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clec18aQ7TSQ1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Clec18aQ7TSQ1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Clec18aQ7TSQ1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clec18aQ7TSQ1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clec18aQ7TSQ1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clec18aQ7TSQ1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Clec18aQ7TSQ1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clec18aQ7TSQ1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clec18aQ7TSQ1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clec18aQ7TSQ1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clec18aQ7TSQ1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clec18aQ7TSQ1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clec18aQ7TSQ1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Clec18aQ7TSQ1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clec18aQ7TSQ1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clec18aQ7TSQ1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clec18aQ7TSQ1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clec18aQ7TSQ1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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