Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ctdp1Q7TSG2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms