Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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