Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ69

Tmc3, Transmembrane channel-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc3Q7TQ69 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmc3Q7TQ69 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmc3Q7TQ69 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms