Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prrc2bQ7TPM1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prrc2bQ7TPM1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prrc2bQ7TPM1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prrc2bQ7TPM1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prrc2bQ7TPM1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prrc2bQ7TPM1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prrc2bQ7TPM1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prrc2bQ7TPM1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prrc2bQ7TPM1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prrc2bQ7TPM1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prrc2bQ7TPM1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Prrc2bQ7TPM1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Prrc2bQ7TPM1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Prrc2bQ7TPM1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Prrc2bQ7TPM1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Prrc2bQ7TPM1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Prrc2bQ7TPM1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prrc2bQ7TPM1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prrc2bQ7TPM1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prrc2bQ7TPM1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prrc2bQ7TPM1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prrc2bQ7TPM1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Prrc2bQ7TPM1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Prrc2bQ7TPM1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Prrc2bQ7TPM1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Prrc2bQ7TPM1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prrc2bQ7TPM1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prrc2bQ7TPM1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prrc2bQ7TPM1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Prrc2bQ7TPM1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prrc2bQ7TPM1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prrc2bQ7TPM1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prrc2bQ7TPM1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prrc2bQ7TPM1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prrc2bQ7TPM1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Prrc2bQ7TPM1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms