Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD6

Raver2, Ribonucleoprotein PTB-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver2Q7TPD6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Raver2Q7TPD6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms