Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms