Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rpf1Q7TND5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms