Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snd1Q78PY7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms