Protein–RNA interactions for Protein: Q78IK2

Usmg5, Up-regulated during skeletal muscle growth protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usmg5Q78IK2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usmg5Q78IK2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms