Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2d2bQ6ZWY6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms