Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Ncapd3Q6ZQK0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ncapd3Q6ZQK0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ncapd3Q6ZQK0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ncapd3Q6ZQK0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Ncapd3Q6ZQK0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ncapd3Q6ZQK0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ncapd3Q6ZQK0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ncapd3Q6ZQK0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ncapd3Q6ZQK0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ncapd3Q6ZQK0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ncapd3Q6ZQK0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Ncapd3Q6ZQK0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ncapd3Q6ZQK0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ncapd3Q6ZQK0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ncapd3Q6ZQK0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ncapd3Q6ZQK0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ncapd3Q6ZQK0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ncapd3Q6ZQK0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ncapd3Q6ZQK0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ncapd3Q6ZQK0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Ncapd3Q6ZQK0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ncapd3Q6ZQK0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ncapd3Q6ZQK0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ncapd3Q6ZQK0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Ncapd3Q6ZQK0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ncapd3Q6ZQK0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ncapd3Q6ZQK0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Ncapd3Q6ZQK0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ncapd3Q6ZQK0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ncapd3Q6ZQK0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ncapd3Q6ZQK0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ncapd3Q6ZQK0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
Ncapd3Q6ZQK0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Ncapd3Q6ZQK0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Ncapd3Q6ZQK0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ncapd3Q6ZQK0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ncapd3Q6ZQK0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ncapd3Q6ZQK0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ncapd3Q6ZQK0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Ncapd3Q6ZQK0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ncapd3Q6ZQK0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ncapd3Q6ZQK0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ncapd3Q6ZQK0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ncapd3Q6ZQK0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ncapd3Q6ZQK0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms