Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPJ3

Ube2o, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2O, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2oQ6ZPJ3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ube2oQ6ZPJ3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ube2oQ6ZPJ3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ube2oQ6ZPJ3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ube2oQ6ZPJ3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ube2oQ6ZPJ3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ube2oQ6ZPJ3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ube2oQ6ZPJ3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ube2oQ6ZPJ3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ube2oQ6ZPJ3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ube2oQ6ZPJ3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ube2oQ6ZPJ3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ube2oQ6ZPJ3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ube2oQ6ZPJ3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ube2oQ6ZPJ3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ube2oQ6ZPJ3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ube2oQ6ZPJ3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ube2oQ6ZPJ3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ube2oQ6ZPJ3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ube2oQ6ZPJ3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ube2oQ6ZPJ3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ube2oQ6ZPJ3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ube2oQ6ZPJ3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ube2oQ6ZPJ3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ube2oQ6ZPJ3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ube2oQ6ZPJ3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ube2oQ6ZPJ3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ube2oQ6ZPJ3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ube2oQ6ZPJ3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ube2oQ6ZPJ3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ube2oQ6ZPJ3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ube2oQ6ZPJ3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ube2oQ6ZPJ3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ube2oQ6ZPJ3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ube2oQ6ZPJ3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ube2oQ6ZPJ3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ube2oQ6ZPJ3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ube2oQ6ZPJ3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ube2oQ6ZPJ3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ube2oQ6ZPJ3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ube2oQ6ZPJ3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube2oQ6ZPJ3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube2oQ6ZPJ3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube2oQ6ZPJ3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube2oQ6ZPJ3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube2oQ6ZPJ3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube2oQ6ZPJ3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube2oQ6ZPJ3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube2oQ6ZPJ3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ube2oQ6ZPJ3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ube2oQ6ZPJ3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ube2oQ6ZPJ3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ube2oQ6ZPJ3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ube2oQ6ZPJ3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ube2oQ6ZPJ3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ube2oQ6ZPJ3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ube2oQ6ZPJ3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms