Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LcorQ6ZPI3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms