Protein–RNA interactions for Protein: Q6XVG2

Cyp2c54, Cytochrome P450 2C54, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c54Q6XVG2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cyp2c54Q6XVG2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp2c54Q6XVG2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms