Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc44a1Q6X893 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms