Protein–RNA interactions for Protein: Q6X1Y6

Asic3, Acid-sensing ion channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic3Q6X1Y6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Asic3Q6X1Y6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Asic3Q6X1Y6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms