Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ift172Q6VH22 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ift172Q6VH22 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ift172Q6VH22 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ift172Q6VH22 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ift172Q6VH22 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ift172Q6VH22 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ift172Q6VH22 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ift172Q6VH22 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ift172Q6VH22 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ift172Q6VH22 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ift172Q6VH22 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ift172Q6VH22 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ift172Q6VH22 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ift172Q6VH22 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ift172Q6VH22 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ift172Q6VH22 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ift172Q6VH22 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ift172Q6VH22 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ift172Q6VH22 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ift172Q6VH22 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ift172Q6VH22 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ift172Q6VH22 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ift172Q6VH22 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ift172Q6VH22 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ift172Q6VH22 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ift172Q6VH22 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ift172Q6VH22 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ift172Q6VH22 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ift172Q6VH22 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms