Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd300lfQ6SJQ7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd300lfQ6SJQ7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms