Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms