Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GcsamQ6RFH4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms