Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q473

Clca4a, Calcium-activated chloride channel regulator 4A, mousemouse

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4aQ6Q473 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clca4aQ6Q473 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms