Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms