Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS9

Cacna2d2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d2Q6PHS9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna2d2Q6PHS9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna2d2Q6PHS9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d2Q6PHS9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d2Q6PHS9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d2Q6PHS9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d2Q6PHS9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d2Q6PHS9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d2Q6PHS9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d2Q6PHS9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d2Q6PHS9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d2Q6PHS9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d2Q6PHS9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d2Q6PHS9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d2Q6PHS9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d2Q6PHS9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d2Q6PHS9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d2Q6PHS9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d2Q6PHS9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d2Q6PHS9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d2Q6PHS9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d2Q6PHS9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d2Q6PHS9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d2Q6PHS9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d2Q6PHS9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d2Q6PHS9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d2Q6PHS9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d2Q6PHS9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d2Q6PHS9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d2Q6PHS9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d2Q6PHS9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cacna2d2Q6PHS9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna2d2Q6PHS9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cacna2d2Q6PHS9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cacna2d2Q6PHS9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cacna2d2Q6PHS9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna2d2Q6PHS9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna2d2Q6PHS9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna2d2Q6PHS9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna2d2Q6PHS9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna2d2Q6PHS9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna2d2Q6PHS9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna2d2Q6PHS9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna2d2Q6PHS9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna2d2Q6PHS9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms