Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx13Q6PHS6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx13Q6PHS6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms