Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc82Q6PG04 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms