Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf1cQ6PDZ2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms