Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vstm2lQ6PDS0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms