Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc36Q6PDM4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms