Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbtb39Q6PDK0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb39Q6PDK0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbtb39Q6PDK0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbtb39Q6PDK0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbtb39Q6PDK0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbtb39Q6PDK0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbtb39Q6PDK0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms