Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms