Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Herc4Q6PAV2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Herc4Q6PAV2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Herc4Q6PAV2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Herc4Q6PAV2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Herc4Q6PAV2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Herc4Q6PAV2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Herc4Q6PAV2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Herc4Q6PAV2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Herc4Q6PAV2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Herc4Q6PAV2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Herc4Q6PAV2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms