Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6I6

Polr2m, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2mQ6P6I6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr2mQ6P6I6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms