Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sik3Q6P4S6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms