Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Frg2f1Q6P3A2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Frg2f1Q6P3A2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Frg2f1Q6P3A2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Frg2f1Q6P3A2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Frg2f1Q6P3A2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Frg2f1Q6P3A2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Frg2f1Q6P3A2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Frg2f1Q6P3A2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Frg2f1Q6P3A2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Frg2f1Q6P3A2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Frg2f1Q6P3A2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Frg2f1Q6P3A2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Frg2f1Q6P3A2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Frg2f1Q6P3A2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Frg2f1Q6P3A2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frg2f1Q6P3A2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms