Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc189Q6NZQ0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc189Q6NZQ0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms