Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Soga3Q6NZL0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
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