Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms