Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXW6

Rad17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad17Q6NXW6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rad17Q6NXW6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Rad17Q6NXW6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rad17Q6NXW6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Rad17Q6NXW6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rad17Q6NXW6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rad17Q6NXW6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Rad17Q6NXW6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rad17Q6NXW6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rad17Q6NXW6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rad17Q6NXW6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Rad17Q6NXW6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Rad17Q6NXW6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rad17Q6NXW6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rad17Q6NXW6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rad17Q6NXW6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rad17Q6NXW6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rad17Q6NXW6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rad17Q6NXW6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rad17Q6NXW6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rad17Q6NXW6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms