Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpsf6Q6NVF9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpsf6Q6NVF9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms