Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HelbQ6NVF4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms