Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms