Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt39Q6IFX4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms