Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg9bQ6EBV9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms