Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Smarca2Q6DIC0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Smarca2Q6DIC0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Smarca2Q6DIC0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Smarca2Q6DIC0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Smarca2Q6DIC0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Smarca2Q6DIC0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Smarca2Q6DIC0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Smarca2Q6DIC0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Smarca2Q6DIC0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Smarca2Q6DIC0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Smarca2Q6DIC0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Smarca2Q6DIC0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Smarca2Q6DIC0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Smarca2Q6DIC0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Smarca2Q6DIC0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Smarca2Q6DIC0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Smarca2Q6DIC0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Smarca2Q6DIC0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Smarca2Q6DIC0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Smarca2Q6DIC0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Smarca2Q6DIC0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Smarca2Q6DIC0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Smarca2Q6DIC0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Smarca2Q6DIC0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Smarca2Q6DIC0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Smarca2Q6DIC0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Smarca2Q6DIC0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Smarca2Q6DIC0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Smarca2Q6DIC0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Smarca2Q6DIC0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Smarca2Q6DIC0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Smarca2Q6DIC0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Smarca2Q6DIC0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Smarca2Q6DIC0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Smarca2Q6DIC0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Smarca2Q6DIC0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Smarca2Q6DIC0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Smarca2Q6DIC0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Smarca2Q6DIC0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Smarca2Q6DIC0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Smarca2Q6DIC0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Smarca2Q6DIC0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Smarca2Q6DIC0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Smarca2Q6DIC0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Smarca2Q6DIC0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Smarca2Q6DIC0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Smarca2Q6DIC0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Smarca2Q6DIC0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Smarca2Q6DIC0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Smarca2Q6DIC0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Smarca2Q6DIC0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Smarca2Q6DIC0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Smarca2Q6DIC0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Smarca2Q6DIC0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Smarca2Q6DIC0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Smarca2Q6DIC0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Smarca2Q6DIC0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Smarca2Q6DIC0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Smarca2Q6DIC0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Smarca2Q6DIC0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Smarca2Q6DIC0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Smarca2Q6DIC0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Smarca2Q6DIC0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Smarca2Q6DIC0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Smarca2Q6DIC0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Smarca2Q6DIC0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Smarca2Q6DIC0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Smarca2Q6DIC0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Smarca2Q6DIC0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms